Bunden af bugten Qinngunnguit dannende efter koloniens flytning hertil rammen om koloniens tidlige historie omkring handel og mission.

Den ældste bygning i området er store røde bygning B-3, der blev opført ved flytningen i 1750-60. Bygningen var bolig og administrationsbygning for skiftende kolonibestyrere frem til 1955. Fra 1955 var huset kontor for Den Kongelige Grønlandske Handel (KGH), indtil det i 1988 blev overdraget til af kommunen til brug som museumsbygning. Bygningen huser i dag museets lokalhistoriske udstillinger og kiosk samt museets kontor. Huset er i opført af til transporterede tømmerstokke i en stokværks-stil typisk for midten af 1700-tallets våningshuse. Huset havde oprindelig klinkbygget tag.

Bygning B-4 – den gule bygning kaldes i daglig tale Den Gamle Butik. Bygningen blev oprindelig opført ved koloniens grundlæggelse på den modsatte side af bugten i 1734. Bygningen blev flyttet til sin nuværende placering i 1806. Efter flytningen til sin nuværende placering har bygningen været brugt som pakhus og lager samt som butik. Efter opførelse af den ny selvbetjeningsbutik for kolonialhandel, forblev bygningen i brug som materiale butik. Bygningen blev i 1990’ernes start fredet og istandsat som museumsbygning, der i dag huser museets magasin og udstilling af arkæologiske genstande fra Saqqaq-kulturen. Bygningen er opført i norsk stokværksstil, og er et af Grønlands ældste træhuse fra kolonitiden. Det oprindelige klinkbyggede tag blev ved fredningen rekonstrueret.

Yderligere om museets bygninger kan læses på www.qasigiannguuit.museum.gl